Appelzaden bevatten amygdaline, een cyanogene glycoside bestaande uit cyanide en suiker. Wanneer deze chemische stof in het spijsverteringsstelsel wordt gemetaboliseerd , wordt deze afgebroken tot het zeer giftige waterstofcyanide (HCN). Een dodelijke dosis HCN kan binnen enkele minuten dodelijk zijn.
Amygdaline is alleen toegankelijk als de zaden zijn geplet of gekauwd; een heel, ongebroken zaadje zal er dwars doorheen gaan. En het menselijk lichaam kan HCN in kleine hoeveelheden verwerken, dus een paar gekauwde zaden zijn meestal volkomen onschadelijk. De gemiddelde volwassene zou tussen de 150 en enkele duizenden gemalen zaden moeten eten (afhankelijk van de appelvariëteit) om het risico te lopen op cyanidevergiftiging 1